Sintesi di building blocks per l’ottimizzazione di reazioni di bio-coniugazione indotte da prossimità

• LM CHIMICA
• LM CHIMICA INDUSTRIALE

Descrizione

Lo sviluppo della chimica bio-ortogonale fu spinto dalla necessità di sviluppare nuove metodologie per l’introduzione di specifiche modificazioni sulle biomolecole nel loro ambito nativo. Queste reazioni coinvolgono gruppi funzionali non presenti in natura e che presentano reattività ortogonali a quelle dei gruppo funzionali presenti nelle biomolecole.

Negli ultimi anni sono state realizzate reazioni bio-ortogonali in grado di avvenire solo in presenza di prossimità tra i gruppi funzionali coinvolti. Un esempio è la reazione tra un 2,5-dione (DOP) e un nucleofilo con effetto α, la cui reazione avviene solo quando le due funzionalità, che sono installate su derivati di acidi peptido nucleici (PNA), sono forzate in prossimità dal un filamento di DNA bersaglio che funge da templante per la reazione.

L’obbiettivo della tesi magistrale è la sintesi di derivati contenenti nucleofili ad effetto alfa adatti per la sintesi in fase solida di derivati peptidici di acidi nucleici e la valutazione della loro reattività in presenza di sistemi 1,4-dichetonici.

Il progetto prevede:

1. sintesi e caratterizzazione (H-NMR, C-NMR, MS) di piccole molecole
2. sintesi, tramite strategie di sintesi peptidica su fase solida, di derivati di acidi nucleici contenenti i sintoni realizzati
3. Valutazione della reattività dei sistemi realizzati in varie condizioni (pH, composizione solvente, temperatura) tramite tecniche cromatografiche ed elettroforetiche
4. Valutazione della selettività della reazione, tramite tecniche cromatografiche ed elettroforetiche

Gli interessati possono contattarmi via e-mail (alex.manicardi@unipr.it) per chiedere maggiori informazioni od un colloquio informale (non vincolante).

Riferimetni Bibliografici
Chem Sci, 2020, 11, 11729–11739
Commun Chem, 2021, 4, 146
Org Lett, 2023, 25, 6618–6622